1、關(guān)于商標轉讓中屬于企業(yè)內部自身問(wèn)題所造成的糾紛屬于民事法律糾紛的范疇，一般情況下需要當事人自己通過(guò)司法訴訟程序來(lái)予以，來(lái)解決維護自己的權益。而商標局作為行政主管部門(mén)，一般不會(huì )介入。但是，如果該商標的轉讓申請還處在商標局轉讓審查進(jìn)程中的，為了便于當事人主張自己的權利，對于這類(lèi)商標轉讓糾紛，商標局會(huì )給于當事人一個(gè)合理的時(shí)限，當事人應該盡快通過(guò)司法訴訟來(lái)主張權利，超過(guò)該時(shí)限，商標局仍然會(huì )繼續進(jìn)行相應的正常商標轉讓審查程序。一旦商標轉讓申請被商標局核準公告后，則該商標轉讓行為已經(jīng)事實(shí)產(chǎn)生法律效力。涉及到法律權限問(wèn)題，當事人只能通過(guò)法院的申請證據保全措施來(lái)暫時(shí)凍結該商標轉讓后的權利實(shí)施，并通過(guò)訴訟書(shū)程序來(lái)解決相關(guān)商標轉讓糾紛。
2、對于假冒、偽造的商標非法轉讓問(wèn)題，則需要通過(guò)當地的公安部門(mén)以偽造印章、文書(shū)，非法侵占財產(chǎn)等進(jìn)行刑事鑒定，然后通過(guò)司法程序解決。
3、對于商標局作出的“不予受理”、“不予核準”等等行政決定的行政糾紛，可以向國家工商總局進(jìn)行反映或者行政復議，或者行政訴訟等途徑解決。
4、注冊商標的轉讓只有在核準公告之日起商標受讓人才擁有該被轉讓商標的全部法律權益，而在注冊商標轉讓核準公告之前，被轉讓商標的實(shí)際權益仍然屬于商標轉讓人。因此，關(guān)于商標在轉讓申請審查進(jìn)行中的商標權益問(wèn)題，只能通過(guò)商標轉讓雙方事先在商標轉讓合同中進(jìn)行相應的權利約定。
為了保護雙方利益，在商標申請前，轉讓人與受讓人最好能夠簽訂一份轉讓協(xié)議，協(xié)議中把上面列出的可能會(huì )涉及到的問(wèn)題都一一做出說(shuō)明，并到當地的公證處做出公證。

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